中國種質資源國家庫貯存的種子達33．3萬份，成為世界上最大的種質資源寶庫，保存了許多具有重要經濟和科研價值的珍稀植物的「血脈」，為它們解除了「絕後」之憂。
由科技部主持的國家科技攻關項目「主要農作物和林木種質資源評價與利用研究」的順利完成，使國家種質庫增加了34種作物2．2萬餘份種子，加上以前入庫的數量，國家庫長期貯存種子數量達到33．3萬份。至此，國家庫保存種質資源數量處於世界第一。同時，國家資源圃保存種質數達到3．8萬份，國家擁有種質資源總數達到37萬份。這一數量僅次於美國貯存的55.5萬份種質資源，位居世界第二。
國家種質資源庫還收集、搶救了三峽、贛南、粵北等開發區的一批珍息瀕危、優異種質和近緣野生植物。三峽庫區瀕臨滅絕的八稜絲瓜、具重要開發價值的紫色爆裂玉米和白色蘇麻等一批珍稀古老種質，都安全地保存在了國家庫裡。
中國國家種質資源庫保存的數量及其多樣性為作物育種和生產提供了雄厚的物質基礎，受到世界各國的關注。中國科研人員通過鑒定、篩選，已創新出一批優異種質，在育種上發揮重要作用。