新生兒出生24小時內排出胎糞。胎糞是由胃腸分泌物、膽汁、上皮細胞、胎毛、胎脂以及咽進去的羊水所組成的，顏色黑綠黏稠，沒有臭味。隨後2~3天排棕褐色的過渡便。以後就轉為正常大便了。由於餵養奶質不同，正常大便也略有差異。母奶餵養的小兒，大便呈黃色或金黃色，軟膏樣，味酸不臭；牛奶餵養的小兒，大便色淡黃，均勻較硬，有臭味。一般吃母奶的新生兒，比牛奶餵養的新生兒大便次數要多，每天4~6次，甚至達7~8次之多。如果母親乳頭有裂傷出血，大便可能呈柏油樣，這都屬於正常大便。大便帶有鮮血，要看新生兒有沒有假月經、肛裂、外傷及尿布疹。如果大便呈稀水樣、蛋花湯樣、綠色發酸，要考慮是餵養不當，飢餓所致。大便灰白色可能為膽道閉鎖。
新生兒往往在生產過程中排出第一次小便，生後第一天可能沒有尿或者排尿4~5次，以後根據攝入量逐漸增長，24小時可達20次。如果生後48小時仍無尿，則要考慮有無泌尿系統的畸形，可先喂糖水並注意觀察。有人認為無尿與新生兒尿中有較多尿酸鹽結晶將腎小管堵塞有關。有時有微量蛋白及尿酸鹽結晶可排紅色尿，多餵水則可糾正。如果多餵水後仍不排尿，應及時請醫生診治。