目前，小兒上呼吸道感染的治療中，抗菌素的應用相當普遍，有的是醫生主張用，而更多的是患兒家長極力要求用。造成這種用藥的原因，從醫生方面講，是因為不能確定致病的病原體是細菌還是病毒，或認為可以預防細菌感染，縮短病程，減輕病情；從患兒家長方面講，對孩子患病不用抗菌素就不放心，更怕耽誤了病情。其實，以上的看法是片面的。
流行病學調查證明，90%以上的上呼吸道感染是由於病毒感染引起的。因此上呼吸道感染時常規應用抗菌素是不合適的。有人研究，一組上呼吸道感染患兒只做一般治療，另一組做各種抗菌素治療，在完成上述治療的500餘例中，兩組退熱時間相仿，合併症發生率也相似，說明抗菌素藥物不能縮短上呼吸道感染的病程，對於降低併發症的發生率並無多大價值。另有人對抗菌素預防上呼吸道感染繼發細菌性肺炎的作用進行了研究，結果治療組與對照組無顯著差異。因此認為，抗菌素應用在已經確診或高度懷疑細菌性感染的患兒，或並發中耳炎。頸部淋巴結炎時，而用於預防上呼吸道感染併發症的發生沒有意義。
由此可見，上呼吸道感染時，使用青黴素、螺旋黴素、頭孢類抗菌素等抗生素不但是錯誤的，而且還會造成病原體對抗菌素產生抗藥性及其不良反應的威脅以及藥物的浪費，應引起醫務工作者和患兒家長的注意。