要解決這個問題首先要知道先心病的發病原因，但確切的病因至今未明。一般認為與下列因素有關：
1.與遺傳有關我們在實際生活中偶然看到，在一個家庭中，兄弟姐妹或父母子女同時患先心病，且所患先心病的性質多半甚為相似。
2.與胎兒的環境及母體有關胎兒的心臟在胚胎頭3個內完成發育，以後僅在大小和功能上有所改變。因此在這個階段，如果母體受到刺激就會影響胎兒的心臟發育。如孕母患風疹、腮腺炎、流行性感冒等病毒感染，孕母服用鎮靜劑、抗生素(主要為四環素、土黴素、金黴素)和激素等藥物，孕母接受大量放射線照射，孕母患糖尿並甲狀腺功能亢進，均可影響胎兒的心臟發育。
雖然目前還缺乏強有力的先心病預防措施，但是，做到以下幾點，可能會減少先心病的發玻
1.在懷孕期間，特別在頭3個月內，孕婦要預防感染，尤其是病毒感染。
2.盡量避免服用不必要的藥物。
3.健康不佳時要避孕。
4.孕期營養要充足，心情要愉快。