得了紅眼病後要積極治療，一般要求要及時、徹底、堅持。一經發現，立即治療，不要中斷，症狀完全消失後仍要繼續治療1周時間，以防復發。治療可沖洗眼睛，在患眼分泌物較多時，宜用適當的沖洗劑如生理鹽水或2%硼酸水沖洗結膜囊，每日2～3次，並用消毒棉簽擦淨瞼緣。也可對患眼點眼藥水或塗眼藥膏。如為細菌性感染，可根據檢查出的菌種選擇最有效的抗生素眼藥水滴眼，根據病情輕重，每2～3小時或每小時點眼藥1次，常用眼藥水有10%～20 %磺胺醋酰鈉、0.3%氟哌酸、0.25%氯黴素眼藥水等，晚上睡前可塗抗生素眼膏，如環丙沙星、金黴素或四環素眼藥膏，每次點藥前需將分泌物擦洗乾淨，以提高療效。對混合病毒感染的結膜炎，除應用以上藥物治療外，還可用抗病毒眼藥水，如為腺病毒可用0.1%羥苄唑眼藥水、0.1%肽丁胺乳劑，如為小病毒可用0.1%皰疹淨、0.1%無環鳥甘眼藥水等，每日2～3次，必要時還可應用干擾素等。有條件時可進行細菌培養，並作藥敏試驗，以選用適當的抗生素。
對紅眼病也可採用中醫治療，中醫稱本病為暴風客熱或天行赤眼，一般為外感風熱邪毒所致，故宜驅風散邪，清熱解毒，常用瀉肺飲和銀翹解毒丸。
當炎症控制後，為預防復發，仍需點眼藥水1周左右，或應用收斂劑，如0.25%硫酸鋅眼藥水，每日2～3次，以改善充血狀態，預防復發。